Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trappc9Q3U0M1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms