Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hace1Q3U0D9 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Hace1Q3U0D9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hace1Q3U0D9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hace1Q3U0D9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hace1Q3U0D9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hace1Q3U0D9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hace1Q3U0D9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hace1Q3U0D9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms