Protein–RNA interactions for Protein: Q3TY92

Mbd6, Methyl-CpG-binding domain protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd6Q3TY92 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd6Q3TY92 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd6Q3TY92 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd6Q3TY92 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd6Q3TY92 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd6Q3TY92 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd6Q3TY92 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd6Q3TY92 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd6Q3TY92 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd6Q3TY92 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd6Q3TY92 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd6Q3TY92 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd6Q3TY92 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd6Q3TY92 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd6Q3TY92 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd6Q3TY92 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd6Q3TY92 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd6Q3TY92 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd6Q3TY92 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd6Q3TY92 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd6Q3TY92 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd6Q3TY92 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd6Q3TY92 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd6Q3TY92 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd6Q3TY92 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd6Q3TY92 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd6Q3TY92 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd6Q3TY92 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd6Q3TY92 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd6Q3TY92 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd6Q3TY92 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd6Q3TY92 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd6Q3TY92 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd6Q3TY92 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd6Q3TY92 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd6Q3TY92 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd6Q3TY92 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd6Q3TY92 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd6Q3TY92 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd6Q3TY92 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd6Q3TY92 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd6Q3TY92 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd6Q3TY92 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mbd6Q3TY92 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mbd6Q3TY92 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mbd6Q3TY92 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mbd6Q3TY92 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mbd6Q3TY92 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd6Q3TY92 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms