Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Ccdc136Q3TVA9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Ccdc136Q3TVA9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Ccdc136Q3TVA9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Ccdc136Q3TVA9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Ccdc136Q3TVA9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Ccdc136Q3TVA9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Ccdc136Q3TVA9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Ccdc136Q3TVA9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Ccdc136Q3TVA9 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Ccdc136Q3TVA9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Ccdc136Q3TVA9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Ccdc136Q3TVA9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Ccdc136Q3TVA9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Ccdc136Q3TVA9 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
Ccdc136Q3TVA9 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Ccdc136Q3TVA9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Ccdc136Q3TVA9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Ccdc136Q3TVA9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Ccdc136Q3TVA9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Ccdc136Q3TVA9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Ccdc136Q3TVA9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Ccdc136Q3TVA9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Ccdc136Q3TVA9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Ccdc136Q3TVA9 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Ccdc136Q3TVA9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Ccdc136Q3TVA9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Ccdc136Q3TVA9 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Ccdc136Q3TVA9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Ccdc136Q3TVA9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Ccdc136Q3TVA9 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Ccdc136Q3TVA9 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Ccdc136Q3TVA9 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
Ccdc136Q3TVA9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Ccdc136Q3TVA9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Ccdc136Q3TVA9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Ccdc136Q3TVA9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Ccdc136Q3TVA9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Ccdc136Q3TVA9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Ccdc136Q3TVA9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Ccdc136Q3TVA9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Ccdc136Q3TVA9 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Ccdc136Q3TVA9 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Ccdc136Q3TVA9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Ccdc136Q3TVA9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Ccdc136Q3TVA9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Ccdc136Q3TVA9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Ccdc136Q3TVA9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Ccdc136Q3TVA9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Ccdc136Q3TVA9 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Ccdc136Q3TVA9 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
Ccdc136Q3TVA9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
Ccdc136Q3TVA9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Ccdc136Q3TVA9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Ccdc136Q3TVA9 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Ccdc136Q3TVA9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Ccdc136Q3TVA9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
Ccdc136Q3TVA9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Ccdc136Q3TVA9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Ccdc136Q3TVA9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Ccdc136Q3TVA9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Ccdc136Q3TVA9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Ccdc136Q3TVA9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Ccdc136Q3TVA9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Ccdc136Q3TVA9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Ccdc136Q3TVA9 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
Ccdc136Q3TVA9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
Ccdc136Q3TVA9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Ccdc136Q3TVA9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Ccdc136Q3TVA9 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Ccdc136Q3TVA9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Ccdc136Q3TVA9 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
Ccdc136Q3TVA9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Ccdc136Q3TVA9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Ccdc136Q3TVA9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Ccdc136Q3TVA9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Ccdc136Q3TVA9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Ccdc136Q3TVA9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Ccdc136Q3TVA9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Ccdc136Q3TVA9 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Ccdc136Q3TVA9 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Ccdc136Q3TVA9 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Ccdc136Q3TVA9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Ccdc136Q3TVA9 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Ccdc136Q3TVA9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Ccdc136Q3TVA9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Ccdc136Q3TVA9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
Ccdc136Q3TVA9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
Ccdc136Q3TVA9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Ccdc136Q3TVA9 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Ccdc136Q3TVA9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Ccdc136Q3TVA9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Ccdc136Q3TVA9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Ccdc136Q3TVA9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Ccdc136Q3TVA9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Ccdc136Q3TVA9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Ccdc136Q3TVA9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Ccdc136Q3TVA9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Ccdc136Q3TVA9 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Ccdc136Q3TVA9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms