Protein–RNA interactions for Protein: Q3TSA9

Fbxw18, Expressed sequence C85627, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxw18Q3TSA9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Fbxw18Q3TSA9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Fbxw18Q3TSA9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fbxw18Q3TSA9 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fbxw18Q3TSA9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fbxw18Q3TSA9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fbxw18Q3TSA9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fbxw18Q3TSA9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fbxw18Q3TSA9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fbxw18Q3TSA9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fbxw18Q3TSA9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fbxw18Q3TSA9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fbxw18Q3TSA9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fbxw18Q3TSA9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fbxw18Q3TSA9 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fbxw18Q3TSA9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fbxw18Q3TSA9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fbxw18Q3TSA9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fbxw18Q3TSA9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fbxw18Q3TSA9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fbxw18Q3TSA9 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Fbxw18Q3TSA9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fbxw18Q3TSA9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fbxw18Q3TSA9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fbxw18Q3TSA9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fbxw18Q3TSA9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fbxw18Q3TSA9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fbxw18Q3TSA9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fbxw18Q3TSA9 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fbxw18Q3TSA9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fbxw18Q3TSA9 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fbxw18Q3TSA9 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fbxw18Q3TSA9 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fbxw18Q3TSA9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fbxw18Q3TSA9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fbxw18Q3TSA9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fbxw18Q3TSA9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fbxw18Q3TSA9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fbxw18Q3TSA9 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fbxw18Q3TSA9 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fbxw18Q3TSA9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fbxw18Q3TSA9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fbxw18Q3TSA9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fbxw18Q3TSA9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fbxw18Q3TSA9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fbxw18Q3TSA9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fbxw18Q3TSA9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fbxw18Q3TSA9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fbxw18Q3TSA9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fbxw18Q3TSA9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fbxw18Q3TSA9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fbxw18Q3TSA9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fbxw18Q3TSA9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fbxw18Q3TSA9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fbxw18Q3TSA9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Fbxw18Q3TSA9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fbxw18Q3TSA9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fbxw18Q3TSA9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fbxw18Q3TSA9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fbxw18Q3TSA9 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fbxw18Q3TSA9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fbxw18Q3TSA9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fbxw18Q3TSA9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fbxw18Q3TSA9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fbxw18Q3TSA9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fbxw18Q3TSA9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Fbxw18Q3TSA9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fbxw18Q3TSA9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fbxw18Q3TSA9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fbxw18Q3TSA9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fbxw18Q3TSA9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fbxw18Q3TSA9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fbxw18Q3TSA9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fbxw18Q3TSA9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fbxw18Q3TSA9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fbxw18Q3TSA9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fbxw18Q3TSA9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fbxw18Q3TSA9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fbxw18Q3TSA9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fbxw18Q3TSA9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fbxw18Q3TSA9 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fbxw18Q3TSA9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fbxw18Q3TSA9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fbxw18Q3TSA9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fbxw18Q3TSA9 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Fbxw18Q3TSA9 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Fbxw18Q3TSA9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fbxw18Q3TSA9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fbxw18Q3TSA9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fbxw18Q3TSA9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fbxw18Q3TSA9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fbxw18Q3TSA9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fbxw18Q3TSA9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fbxw18Q3TSA9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fbxw18Q3TSA9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fbxw18Q3TSA9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fbxw18Q3TSA9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fbxw18Q3TSA9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fbxw18Q3TSA9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fbxw18Q3TSA9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms