Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQS0

Calr4, Calreticulin 4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr4Q3TQS0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Calr4Q3TQS0 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Calr4Q3TQS0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Calr4Q3TQS0 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Calr4Q3TQS0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Calr4Q3TQS0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Calr4Q3TQS0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Calr4Q3TQS0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Calr4Q3TQS0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Calr4Q3TQS0 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Calr4Q3TQS0 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Calr4Q3TQS0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Calr4Q3TQS0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Calr4Q3TQS0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Calr4Q3TQS0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Calr4Q3TQS0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Calr4Q3TQS0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Calr4Q3TQS0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Calr4Q3TQS0 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Calr4Q3TQS0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Calr4Q3TQS0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Calr4Q3TQS0 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Calr4Q3TQS0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Calr4Q3TQS0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Calr4Q3TQS0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Calr4Q3TQS0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Calr4Q3TQS0 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Calr4Q3TQS0 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Calr4Q3TQS0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Calr4Q3TQS0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Calr4Q3TQS0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Calr4Q3TQS0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Calr4Q3TQS0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Calr4Q3TQS0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Calr4Q3TQS0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Calr4Q3TQS0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Calr4Q3TQS0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Calr4Q3TQS0 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Calr4Q3TQS0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Calr4Q3TQS0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Calr4Q3TQS0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Calr4Q3TQS0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Calr4Q3TQS0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Calr4Q3TQS0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Calr4Q3TQS0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Calr4Q3TQS0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Calr4Q3TQS0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Calr4Q3TQS0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Calr4Q3TQS0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Calr4Q3TQS0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Calr4Q3TQS0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Calr4Q3TQS0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Calr4Q3TQS0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Calr4Q3TQS0 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Calr4Q3TQS0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Calr4Q3TQS0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Calr4Q3TQS0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Calr4Q3TQS0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Calr4Q3TQS0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Calr4Q3TQS0 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Calr4Q3TQS0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Calr4Q3TQS0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Calr4Q3TQS0 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Calr4Q3TQS0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Calr4Q3TQS0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Calr4Q3TQS0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Calr4Q3TQS0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Calr4Q3TQS0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Calr4Q3TQS0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Calr4Q3TQS0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Calr4Q3TQS0 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Calr4Q3TQS0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Calr4Q3TQS0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Calr4Q3TQS0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Calr4Q3TQS0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Calr4Q3TQS0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Calr4Q3TQS0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Calr4Q3TQS0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Calr4Q3TQS0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Calr4Q3TQS0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Calr4Q3TQS0 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Calr4Q3TQS0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Calr4Q3TQS0 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Calr4Q3TQS0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Calr4Q3TQS0 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Calr4Q3TQS0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Calr4Q3TQS0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Calr4Q3TQS0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Calr4Q3TQS0 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Calr4Q3TQS0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Calr4Q3TQS0 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Calr4Q3TQS0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Calr4Q3TQS0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Calr4Q3TQS0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Calr4Q3TQS0 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Calr4Q3TQS0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Calr4Q3TQS0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Calr4Q3TQS0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Calr4Q3TQS0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Calr4Q3TQS0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms