Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc102aQ3TMW1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc102aQ3TMW1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc102aQ3TMW1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc102aQ3TMW1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc102aQ3TMW1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc102aQ3TMW1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc102aQ3TMW1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc102aQ3TMW1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc102aQ3TMW1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc102aQ3TMW1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc102aQ3TMW1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc102aQ3TMW1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc102aQ3TMW1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc102aQ3TMW1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc102aQ3TMW1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc102aQ3TMW1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc102aQ3TMW1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc102aQ3TMW1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc102aQ3TMW1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc102aQ3TMW1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc102aQ3TMW1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc102aQ3TMW1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc102aQ3TMW1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc102aQ3TMW1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc102aQ3TMW1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc102aQ3TMW1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc102aQ3TMW1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc102aQ3TMW1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc102aQ3TMW1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc102aQ3TMW1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms