Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trappc13Q3TIR1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc13Q3TIR1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc13Q3TIR1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc13Q3TIR1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc13Q3TIR1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc13Q3TIR1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc13Q3TIR1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc13Q3TIR1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc13Q3TIR1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc13Q3TIR1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc13Q3TIR1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc13Q3TIR1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc13Q3TIR1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc13Q3TIR1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc13Q3TIR1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc13Q3TIR1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc13Q3TIR1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc13Q3TIR1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc13Q3TIR1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc13Q3TIR1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc13Q3TIR1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc13Q3TIR1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc13Q3TIR1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc13Q3TIR1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc13Q3TIR1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc13Q3TIR1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc13Q3TIR1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc13Q3TIR1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc13Q3TIR1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc13Q3TIR1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc13Q3TIR1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc13Q3TIR1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc13Q3TIR1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc13Q3TIR1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc13Q3TIR1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc13Q3TIR1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc13Q3TIR1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc13Q3TIR1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc13Q3TIR1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc13Q3TIR1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc13Q3TIR1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc13Q3TIR1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc13Q3TIR1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc13Q3TIR1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc13Q3TIR1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc13Q3TIR1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc13Q3TIR1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc13Q3TIR1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc13Q3TIR1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc13Q3TIR1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc13Q3TIR1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc13Q3TIR1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc13Q3TIR1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc13Q3TIR1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc13Q3TIR1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc13Q3TIR1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc13Q3TIR1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc13Q3TIR1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc13Q3TIR1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc13Q3TIR1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc13Q3TIR1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc13Q3TIR1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc13Q3TIR1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc13Q3TIR1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc13Q3TIR1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc13Q3TIR1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc13Q3TIR1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc13Q3TIR1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc13Q3TIR1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc13Q3TIR1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc13Q3TIR1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc13Q3TIR1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc13Q3TIR1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc13Q3TIR1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms