Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD49

Sppl2b, Signal peptide peptidase-like 2B, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl2bQ3TD49 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sppl2bQ3TD49 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Sppl2bQ3TD49 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sppl2bQ3TD49 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sppl2bQ3TD49 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sppl2bQ3TD49 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sppl2bQ3TD49 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sppl2bQ3TD49 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sppl2bQ3TD49 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Sppl2bQ3TD49 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sppl2bQ3TD49 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sppl2bQ3TD49 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sppl2bQ3TD49 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sppl2bQ3TD49 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sppl2bQ3TD49 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sppl2bQ3TD49 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sppl2bQ3TD49 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sppl2bQ3TD49 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sppl2bQ3TD49 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sppl2bQ3TD49 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sppl2bQ3TD49 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sppl2bQ3TD49 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sppl2bQ3TD49 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sppl2bQ3TD49 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Sppl2bQ3TD49 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sppl2bQ3TD49 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sppl2bQ3TD49 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Sppl2bQ3TD49 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sppl2bQ3TD49 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sppl2bQ3TD49 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sppl2bQ3TD49 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sppl2bQ3TD49 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sppl2bQ3TD49 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sppl2bQ3TD49 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sppl2bQ3TD49 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sppl2bQ3TD49 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Sppl2bQ3TD49 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sppl2bQ3TD49 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sppl2bQ3TD49 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sppl2bQ3TD49 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sppl2bQ3TD49 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sppl2bQ3TD49 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sppl2bQ3TD49 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sppl2bQ3TD49 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sppl2bQ3TD49 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sppl2bQ3TD49 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sppl2bQ3TD49 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sppl2bQ3TD49 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sppl2bQ3TD49 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sppl2bQ3TD49 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sppl2bQ3TD49 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sppl2bQ3TD49 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sppl2bQ3TD49 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sppl2bQ3TD49 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sppl2bQ3TD49 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sppl2bQ3TD49 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sppl2bQ3TD49 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sppl2bQ3TD49 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sppl2bQ3TD49 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sppl2bQ3TD49 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sppl2bQ3TD49 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sppl2bQ3TD49 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sppl2bQ3TD49 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sppl2bQ3TD49 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sppl2bQ3TD49 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sppl2bQ3TD49 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sppl2bQ3TD49 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sppl2bQ3TD49 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sppl2bQ3TD49 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sppl2bQ3TD49 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sppl2bQ3TD49 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sppl2bQ3TD49 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sppl2bQ3TD49 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sppl2bQ3TD49 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sppl2bQ3TD49 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sppl2bQ3TD49 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sppl2bQ3TD49 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sppl2bQ3TD49 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Sppl2bQ3TD49 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Sppl2bQ3TD49 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Sppl2bQ3TD49 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sppl2bQ3TD49 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sppl2bQ3TD49 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sppl2bQ3TD49 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sppl2bQ3TD49 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Sppl2bQ3TD49 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sppl2bQ3TD49 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sppl2bQ3TD49 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sppl2bQ3TD49 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sppl2bQ3TD49 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Sppl2bQ3TD49 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Sppl2bQ3TD49 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Sppl2bQ3TD49 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sppl2bQ3TD49 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sppl2bQ3TD49 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sppl2bQ3TD49 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sppl2bQ3TD49 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sppl2bQ3TD49 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sppl2bQ3TD49 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sppl2bQ3TD49 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms