Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYK4

Vrtn, Vertnin, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VrtnQ3SYK4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
VrtnQ3SYK4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
VrtnQ3SYK4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
VrtnQ3SYK4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
VrtnQ3SYK4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
VrtnQ3SYK4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
VrtnQ3SYK4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
VrtnQ3SYK4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms