Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-M3Q31093 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms