Protein–RNA interactions for Protein: Q30KN3

Defb33, Beta-defensin 33, mousemouse

Predictions only

Length 62 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb33Q30KN3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defb33Q30KN3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defb33Q30KN3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defb33Q30KN3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defb33Q30KN3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defb33Q30KN3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defb33Q30KN3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defb33Q30KN3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Defb33Q30KN3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defb33Q30KN3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defb33Q30KN3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Defb33Q30KN3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defb33Q30KN3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defb33Q30KN3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defb33Q30KN3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Defb33Q30KN3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Defb33Q30KN3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defb33Q30KN3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defb33Q30KN3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Defb33Q30KN3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Defb33Q30KN3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defb33Q30KN3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defb33Q30KN3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defb33Q30KN3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defb33Q30KN3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defb33Q30KN3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defb33Q30KN3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defb33Q30KN3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defb33Q30KN3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defb33Q30KN3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defb33Q30KN3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defb33Q30KN3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Defb33Q30KN3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defb33Q30KN3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defb33Q30KN3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defb33Q30KN3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defb33Q30KN3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defb33Q30KN3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defb33Q30KN3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Defb33Q30KN3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defb33Q30KN3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defb33Q30KN3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defb33Q30KN3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Defb33Q30KN3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defb33Q30KN3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defb33Q30KN3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
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Defb33Q30KN3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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Defb33Q30KN3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defb33Q30KN3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defb33Q30KN3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defb33Q30KN3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defb33Q30KN3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defb33Q30KN3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defb33Q30KN3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defb33Q30KN3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defb33Q30KN3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Defb33Q30KN3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defb33Q30KN3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defb33Q30KN3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defb33Q30KN3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defb33Q30KN3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Defb33Q30KN3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defb33Q30KN3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Defb33Q30KN3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Defb33Q30KN3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defb33Q30KN3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defb33Q30KN3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defb33Q30KN3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defb33Q30KN3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defb33Q30KN3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defb33Q30KN3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defb33Q30KN3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Defb33Q30KN3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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