Protein–RNA interactions for Protein: Q2V6D6

Gbp8, Guanylate-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp8Q2V6D6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbp8Q2V6D6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbp8Q2V6D6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbp8Q2V6D6 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp8Q2V6D6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp8Q2V6D6 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp8Q2V6D6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp8Q2V6D6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp8Q2V6D6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp8Q2V6D6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp8Q2V6D6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp8Q2V6D6 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp8Q2V6D6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp8Q2V6D6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp8Q2V6D6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp8Q2V6D6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp8Q2V6D6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp8Q2V6D6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp8Q2V6D6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp8Q2V6D6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp8Q2V6D6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp8Q2V6D6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp8Q2V6D6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp8Q2V6D6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp8Q2V6D6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp8Q2V6D6 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp8Q2V6D6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp8Q2V6D6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbp8Q2V6D6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbp8Q2V6D6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbp8Q2V6D6 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbp8Q2V6D6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbp8Q2V6D6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbp8Q2V6D6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbp8Q2V6D6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbp8Q2V6D6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbp8Q2V6D6 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbp8Q2V6D6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbp8Q2V6D6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbp8Q2V6D6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbp8Q2V6D6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbp8Q2V6D6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbp8Q2V6D6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbp8Q2V6D6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbp8Q2V6D6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbp8Q2V6D6 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbp8Q2V6D6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbp8Q2V6D6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbp8Q2V6D6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms