Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Shroom4Q1W617 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Shroom4Q1W617 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Shroom4Q1W617 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Shroom4Q1W617 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Shroom4Q1W617 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Shroom4Q1W617 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Shroom4Q1W617 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Shroom4Q1W617 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Shroom4Q1W617 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Shroom4Q1W617 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Shroom4Q1W617 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Shroom4Q1W617 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Shroom4Q1W617 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Shroom4Q1W617 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Shroom4Q1W617 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Shroom4Q1W617 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Shroom4Q1W617 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Shroom4Q1W617 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Shroom4Q1W617 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Shroom4Q1W617 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Shroom4Q1W617 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Shroom4Q1W617 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Shroom4Q1W617 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Shroom4Q1W617 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Shroom4Q1W617 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Shroom4Q1W617 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Shroom4Q1W617 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Shroom4Q1W617 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Shroom4Q1W617 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Shroom4Q1W617 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Shroom4Q1W617 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Shroom4Q1W617 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Shroom4Q1W617 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Shroom4Q1W617 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Shroom4Q1W617 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Shroom4Q1W617 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Shroom4Q1W617 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Shroom4Q1W617 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Shroom4Q1W617 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Shroom4Q1W617 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Shroom4Q1W617 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Shroom4Q1W617 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Shroom4Q1W617 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Shroom4Q1W617 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Shroom4Q1W617 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Shroom4Q1W617 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Shroom4Q1W617 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Shroom4Q1W617 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Shroom4Q1W617 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Shroom4Q1W617 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Shroom4Q1W617 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Shroom4Q1W617 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Shroom4Q1W617 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Shroom4Q1W617 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Shroom4Q1W617 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
Shroom4Q1W617 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Shroom4Q1W617 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Shroom4Q1W617 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Shroom4Q1W617 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Shroom4Q1W617 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Shroom4Q1W617 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Shroom4Q1W617 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Shroom4Q1W617 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Shroom4Q1W617 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Shroom4Q1W617 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Shroom4Q1W617 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Shroom4Q1W617 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Shroom4Q1W617 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Shroom4Q1W617 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Shroom4Q1W617 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Shroom4Q1W617 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Shroom4Q1W617 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Shroom4Q1W617 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Shroom4Q1W617 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Shroom4Q1W617 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Shroom4Q1W617 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Shroom4Q1W617 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Shroom4Q1W617 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Shroom4Q1W617 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Shroom4Q1W617 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Shroom4Q1W617 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Shroom4Q1W617 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Shroom4Q1W617 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Shroom4Q1W617 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Shroom4Q1W617 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Shroom4Q1W617 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Shroom4Q1W617 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Shroom4Q1W617 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Shroom4Q1W617 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Shroom4Q1W617 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Shroom4Q1W617 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Shroom4Q1W617 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Shroom4Q1W617 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Shroom4Q1W617 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Shroom4Q1W617 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Shroom4Q1W617 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Shroom4Q1W617 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Shroom4Q1W617 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Shroom4Q1W617 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms