Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cers3Q1A3B0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cers3Q1A3B0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cers3Q1A3B0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cers3Q1A3B0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cers3Q1A3B0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cers3Q1A3B0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cers3Q1A3B0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cers3Q1A3B0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cers3Q1A3B0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cers3Q1A3B0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cers3Q1A3B0 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cers3Q1A3B0 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cers3Q1A3B0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cers3Q1A3B0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cers3Q1A3B0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cers3Q1A3B0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cers3Q1A3B0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cers3Q1A3B0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cers3Q1A3B0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cers3Q1A3B0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cers3Q1A3B0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cers3Q1A3B0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cers3Q1A3B0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cers3Q1A3B0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cers3Q1A3B0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cers3Q1A3B0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cers3Q1A3B0 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cers3Q1A3B0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cers3Q1A3B0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cers3Q1A3B0 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cers3Q1A3B0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cers3Q1A3B0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cers3Q1A3B0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cers3Q1A3B0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cers3Q1A3B0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cers3Q1A3B0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cers3Q1A3B0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cers3Q1A3B0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cers3Q1A3B0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cers3Q1A3B0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cers3Q1A3B0 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cers3Q1A3B0 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cers3Q1A3B0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cers3Q1A3B0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cers3Q1A3B0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cers3Q1A3B0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cers3Q1A3B0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cers3Q1A3B0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cers3Q1A3B0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cers3Q1A3B0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cers3Q1A3B0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cers3Q1A3B0 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cers3Q1A3B0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cers3Q1A3B0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cers3Q1A3B0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cers3Q1A3B0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cers3Q1A3B0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cers3Q1A3B0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cers3Q1A3B0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cers3Q1A3B0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cers3Q1A3B0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cers3Q1A3B0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cers3Q1A3B0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cers3Q1A3B0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cers3Q1A3B0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cers3Q1A3B0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cers3Q1A3B0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cers3Q1A3B0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cers3Q1A3B0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cers3Q1A3B0 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cers3Q1A3B0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cers3Q1A3B0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cers3Q1A3B0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cers3Q1A3B0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cers3Q1A3B0 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cers3Q1A3B0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cers3Q1A3B0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cers3Q1A3B0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cers3Q1A3B0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cers3Q1A3B0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cers3Q1A3B0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cers3Q1A3B0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cers3Q1A3B0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cers3Q1A3B0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cers3Q1A3B0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cers3Q1A3B0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cers3Q1A3B0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cers3Q1A3B0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cers3Q1A3B0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cers3Q1A3B0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cers3Q1A3B0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cers3Q1A3B0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cers3Q1A3B0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cers3Q1A3B0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cers3Q1A3B0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cers3Q1A3B0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cers3Q1A3B0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cers3Q1A3B0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cers3Q1A3B0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
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