Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

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Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fam171bQ14CH0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam171bQ14CH0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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