Protein–RNA interactions for Protein: Q14BE7

Fam47c, Family with sequence similarity 47, member A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam47cQ14BE7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam47cQ14BE7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam47cQ14BE7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam47cQ14BE7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam47cQ14BE7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam47cQ14BE7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam47cQ14BE7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam47cQ14BE7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam47cQ14BE7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam47cQ14BE7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam47cQ14BE7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam47cQ14BE7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam47cQ14BE7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam47cQ14BE7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam47cQ14BE7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam47cQ14BE7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam47cQ14BE7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam47cQ14BE7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam47cQ14BE7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam47cQ14BE7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam47cQ14BE7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam47cQ14BE7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam47cQ14BE7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam47cQ14BE7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam47cQ14BE7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam47cQ14BE7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam47cQ14BE7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam47cQ14BE7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam47cQ14BE7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam47cQ14BE7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam47cQ14BE7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam47cQ14BE7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam47cQ14BE7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam47cQ14BE7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam47cQ14BE7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam47cQ14BE7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam47cQ14BE7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam47cQ14BE7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam47cQ14BE7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam47cQ14BE7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam47cQ14BE7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam47cQ14BE7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam47cQ14BE7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam47cQ14BE7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam47cQ14BE7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam47cQ14BE7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam47cQ14BE7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam47cQ14BE7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam47cQ14BE7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam47cQ14BE7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam47cQ14BE7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam47cQ14BE7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam47cQ14BE7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam47cQ14BE7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam47cQ14BE7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam47cQ14BE7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fam47cQ14BE7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fam47cQ14BE7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fam47cQ14BE7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fam47cQ14BE7 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fam47cQ14BE7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fam47cQ14BE7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fam47cQ14BE7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fam47cQ14BE7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fam47cQ14BE7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fam47cQ14BE7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fam47cQ14BE7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fam47cQ14BE7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fam47cQ14BE7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Fam47cQ14BE7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fam47cQ14BE7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fam47cQ14BE7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fam47cQ14BE7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fam47cQ14BE7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fam47cQ14BE7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fam47cQ14BE7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fam47cQ14BE7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fam47cQ14BE7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fam47cQ14BE7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam47cQ14BE7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam47cQ14BE7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam47cQ14BE7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam47cQ14BE7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam47cQ14BE7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam47cQ14BE7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam47cQ14BE7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam47cQ14BE7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam47cQ14BE7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam47cQ14BE7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam47cQ14BE7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam47cQ14BE7 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam47cQ14BE7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam47cQ14BE7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam47cQ14BE7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam47cQ14BE7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam47cQ14BE7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam47cQ14BE7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam47cQ14BE7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam47cQ14BE7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam47cQ14BE7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms