Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
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