Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpusd3Q14AI6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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