Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VgfQ0VGU4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VgfQ0VGU4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VgfQ0VGU4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VgfQ0VGU4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VgfQ0VGU4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VgfQ0VGU4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VgfQ0VGU4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VgfQ0VGU4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VgfQ0VGU4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
VgfQ0VGU4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VgfQ0VGU4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VgfQ0VGU4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VgfQ0VGU4 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VgfQ0VGU4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VgfQ0VGU4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VgfQ0VGU4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VgfQ0VGU4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VgfQ0VGU4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VgfQ0VGU4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
VgfQ0VGU4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VgfQ0VGU4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VgfQ0VGU4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VgfQ0VGU4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VgfQ0VGU4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VgfQ0VGU4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VgfQ0VGU4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VgfQ0VGU4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VgfQ0VGU4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VgfQ0VGU4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VgfQ0VGU4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
VgfQ0VGU4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VgfQ0VGU4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VgfQ0VGU4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VgfQ0VGU4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VgfQ0VGU4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VgfQ0VGU4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VgfQ0VGU4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VgfQ0VGU4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VgfQ0VGU4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VgfQ0VGU4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VgfQ0VGU4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VgfQ0VGU4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VgfQ0VGU4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VgfQ0VGU4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VgfQ0VGU4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VgfQ0VGU4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VgfQ0VGU4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VgfQ0VGU4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VgfQ0VGU4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VgfQ0VGU4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VgfQ0VGU4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VgfQ0VGU4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VgfQ0VGU4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VgfQ0VGU4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VgfQ0VGU4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VgfQ0VGU4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VgfQ0VGU4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VgfQ0VGU4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VgfQ0VGU4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VgfQ0VGU4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VgfQ0VGU4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VgfQ0VGU4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VgfQ0VGU4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VgfQ0VGU4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VgfQ0VGU4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VgfQ0VGU4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VgfQ0VGU4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
VgfQ0VGU4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VgfQ0VGU4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
VgfQ0VGU4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VgfQ0VGU4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VgfQ0VGU4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VgfQ0VGU4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VgfQ0VGU4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VgfQ0VGU4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VgfQ0VGU4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VgfQ0VGU4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VgfQ0VGU4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
VgfQ0VGU4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VgfQ0VGU4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VgfQ0VGU4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VgfQ0VGU4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VgfQ0VGU4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VgfQ0VGU4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VgfQ0VGU4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VgfQ0VGU4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VgfQ0VGU4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VgfQ0VGU4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VgfQ0VGU4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VgfQ0VGU4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VgfQ0VGU4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VgfQ0VGU4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VgfQ0VGU4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VgfQ0VGU4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VgfQ0VGU4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VgfQ0VGU4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VgfQ0VGU4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VgfQ0VGU4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
VgfQ0VGU4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms