Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ttc39dQ0VF76 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Ttc39dQ0VF76 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Ttc39dQ0VF76 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ttc39dQ0VF76 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ttc39dQ0VF76 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Ttc39dQ0VF76 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Ttc39dQ0VF76 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Ttc39dQ0VF76 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Ttc39dQ0VF76 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Ttc39dQ0VF76 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Ttc39dQ0VF76 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Ttc39dQ0VF76 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Ttc39dQ0VF76 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ttc39dQ0VF76 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ttc39dQ0VF76 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Ttc39dQ0VF76 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Ttc39dQ0VF76 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ttc39dQ0VF76 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ttc39dQ0VF76 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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