Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp2b3Q0VF55 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Atp2b3Q0VF55 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Atp2b3Q0VF55 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Atp2b3Q0VF55 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Atp2b3Q0VF55 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp2b3Q0VF55 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp2b3Q0VF55 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp2b3Q0VF55 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp2b3Q0VF55 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp2b3Q0VF55 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp2b3Q0VF55 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp2b3Q0VF55 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp2b3Q0VF55 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp2b3Q0VF55 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp2b3Q0VF55 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp2b3Q0VF55 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp2b3Q0VF55 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp2b3Q0VF55 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp2b3Q0VF55 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp2b3Q0VF55 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp2b3Q0VF55 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp2b3Q0VF55 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp2b3Q0VF55 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp2b3Q0VF55 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp2b3Q0VF55 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp2b3Q0VF55 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp2b3Q0VF55 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp2b3Q0VF55 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp2b3Q0VF55 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp2b3Q0VF55 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp2b3Q0VF55 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp2b3Q0VF55 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp2b3Q0VF55 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp2b3Q0VF55 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp2b3Q0VF55 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp2b3Q0VF55 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp2b3Q0VF55 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp2b3Q0VF55 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp2b3Q0VF55 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp2b3Q0VF55 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp2b3Q0VF55 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp2b3Q0VF55 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp2b3Q0VF55 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp2b3Q0VF55 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp2b3Q0VF55 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp2b3Q0VF55 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp2b3Q0VF55 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp2b3Q0VF55 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp2b3Q0VF55 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp2b3Q0VF55 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp2b3Q0VF55 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp2b3Q0VF55 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp2b3Q0VF55 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp2b3Q0VF55 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp2b3Q0VF55 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp2b3Q0VF55 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp2b3Q0VF55 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp2b3Q0VF55 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp2b3Q0VF55 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp2b3Q0VF55 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp2b3Q0VF55 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp2b3Q0VF55 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp2b3Q0VF55 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp2b3Q0VF55 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp2b3Q0VF55 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp2b3Q0VF55 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp2b3Q0VF55 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp2b3Q0VF55 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp2b3Q0VF55 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp2b3Q0VF55 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp2b3Q0VF55 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp2b3Q0VF55 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp2b3Q0VF55 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp2b3Q0VF55 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp2b3Q0VF55 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp2b3Q0VF55 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp2b3Q0VF55 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms