Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TrioQ0KL02 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TrioQ0KL02 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TrioQ0KL02 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TrioQ0KL02 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TrioQ0KL02 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TrioQ0KL02 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TrioQ0KL02 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TrioQ0KL02 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TrioQ0KL02 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TrioQ0KL02 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TrioQ0KL02 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TrioQ0KL02 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TrioQ0KL02 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TrioQ0KL02 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TrioQ0KL02 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TrioQ0KL02 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TrioQ0KL02 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TrioQ0KL02 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TrioQ0KL02 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TrioQ0KL02 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TrioQ0KL02 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TrioQ0KL02 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TrioQ0KL02 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TrioQ0KL02 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TrioQ0KL02 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TrioQ0KL02 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TrioQ0KL02 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TrioQ0KL02 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TrioQ0KL02 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TrioQ0KL02 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TrioQ0KL02 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TrioQ0KL02 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TrioQ0KL02 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TrioQ0KL02 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TrioQ0KL02 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TrioQ0KL02 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TrioQ0KL02 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TrioQ0KL02 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TrioQ0KL02 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TrioQ0KL02 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TrioQ0KL02 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TrioQ0KL02 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TrioQ0KL02 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TrioQ0KL02 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TrioQ0KL02 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TrioQ0KL02 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TrioQ0KL02 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TrioQ0KL02 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TrioQ0KL02 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TrioQ0KL02 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TrioQ0KL02 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms