Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Znf541Q0GGX2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Znf541Q0GGX2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Znf541Q0GGX2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Znf541Q0GGX2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Znf541Q0GGX2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Znf541Q0GGX2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Znf541Q0GGX2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Znf541Q0GGX2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Znf541Q0GGX2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Znf541Q0GGX2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Znf541Q0GGX2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Znf541Q0GGX2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Znf541Q0GGX2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Znf541Q0GGX2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Znf541Q0GGX2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Znf541Q0GGX2 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Znf541Q0GGX2 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Znf541Q0GGX2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Znf541Q0GGX2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Znf541Q0GGX2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Znf541Q0GGX2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Znf541Q0GGX2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Znf541Q0GGX2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Znf541Q0GGX2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Znf541Q0GGX2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Znf541Q0GGX2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Znf541Q0GGX2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Znf541Q0GGX2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Znf541Q0GGX2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Znf541Q0GGX2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Znf541Q0GGX2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Znf541Q0GGX2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Znf541Q0GGX2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Znf541Q0GGX2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Znf541Q0GGX2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Znf541Q0GGX2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Znf541Q0GGX2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Znf541Q0GGX2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Znf541Q0GGX2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Znf541Q0GGX2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Znf541Q0GGX2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Znf541Q0GGX2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Znf541Q0GGX2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Znf541Q0GGX2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Znf541Q0GGX2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Znf541Q0GGX2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Znf541Q0GGX2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Znf541Q0GGX2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Znf541Q0GGX2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Znf541Q0GGX2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Znf541Q0GGX2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Znf541Q0GGX2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Znf541Q0GGX2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Znf541Q0GGX2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Znf541Q0GGX2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Znf541Q0GGX2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Znf541Q0GGX2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Znf541Q0GGX2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Znf541Q0GGX2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Znf541Q0GGX2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Znf541Q0GGX2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Znf541Q0GGX2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Znf541Q0GGX2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Znf541Q0GGX2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Znf541Q0GGX2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Znf541Q0GGX2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Znf541Q0GGX2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Znf541Q0GGX2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Znf541Q0GGX2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Znf541Q0GGX2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Znf541Q0GGX2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Znf541Q0GGX2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Znf541Q0GGX2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Znf541Q0GGX2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Znf541Q0GGX2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Znf541Q0GGX2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Znf541Q0GGX2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Znf541Q0GGX2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Znf541Q0GGX2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Znf541Q0GGX2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Znf541Q0GGX2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Znf541Q0GGX2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Znf541Q0GGX2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Znf541Q0GGX2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Znf541Q0GGX2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Znf541Q0GGX2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Znf541Q0GGX2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Znf541Q0GGX2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Znf541Q0GGX2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Znf541Q0GGX2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Znf541Q0GGX2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Znf541Q0GGX2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Znf541Q0GGX2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Znf541Q0GGX2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Znf541Q0GGX2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Znf541Q0GGX2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Znf541Q0GGX2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Znf541Q0GGX2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Znf541Q0GGX2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms