Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
1700061G19RikQ08EE8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700061G19RikQ08EE8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
1700061G19RikQ08EE8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700061G19RikQ08EE8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700061G19RikQ08EE8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700061G19RikQ08EE8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700061G19RikQ08EE8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700061G19RikQ08EE8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700061G19RikQ08EE8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700061G19RikQ08EE8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700061G19RikQ08EE8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700061G19RikQ08EE8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700061G19RikQ08EE8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700061G19RikQ08EE8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700061G19RikQ08EE8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700061G19RikQ08EE8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
1700061G19RikQ08EE8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700061G19RikQ08EE8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700061G19RikQ08EE8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
1700061G19RikQ08EE8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700061G19RikQ08EE8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700061G19RikQ08EE8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700061G19RikQ08EE8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700061G19RikQ08EE8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700061G19RikQ08EE8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700061G19RikQ08EE8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700061G19RikQ08EE8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700061G19RikQ08EE8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700061G19RikQ08EE8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms