Protein–RNA interactions for Protein: Q08297

Rad51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad51Q08297 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rad51Q08297 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rad51Q08297 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rad51Q08297 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rad51Q08297 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rad51Q08297 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rad51Q08297 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rad51Q08297 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rad51Q08297 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rad51Q08297 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rad51Q08297 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rad51Q08297 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rad51Q08297 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rad51Q08297 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rad51Q08297 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rad51Q08297 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rad51Q08297 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rad51Q08297 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rad51Q08297 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rad51Q08297 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rad51Q08297 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rad51Q08297 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rad51Q08297 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rad51Q08297 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rad51Q08297 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rad51Q08297 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rad51Q08297 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rad51Q08297 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rad51Q08297 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rad51Q08297 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rad51Q08297 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rad51Q08297 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rad51Q08297 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rad51Q08297 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rad51Q08297 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rad51Q08297 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rad51Q08297 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rad51Q08297 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rad51Q08297 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rad51Q08297 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rad51Q08297 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rad51Q08297 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rad51Q08297 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rad51Q08297 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rad51Q08297 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rad51Q08297 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rad51Q08297 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rad51Q08297 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rad51Q08297 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rad51Q08297 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rad51Q08297 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rad51Q08297 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rad51Q08297 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rad51Q08297 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rad51Q08297 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rad51Q08297 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rad51Q08297 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rad51Q08297 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rad51Q08297 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rad51Q08297 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rad51Q08297 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rad51Q08297 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rad51Q08297 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rad51Q08297 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rad51Q08297 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rad51Q08297 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rad51Q08297 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rad51Q08297 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rad51Q08297 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rad51Q08297 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rad51Q08297 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rad51Q08297 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rad51Q08297 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rad51Q08297 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rad51Q08297 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rad51Q08297 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rad51Q08297 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rad51Q08297 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rad51Q08297 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rad51Q08297 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rad51Q08297 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rad51Q08297 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rad51Q08297 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rad51Q08297 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rad51Q08297 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rad51Q08297 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rad51Q08297 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rad51Q08297 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rad51Q08297 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rad51Q08297 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rad51Q08297 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rad51Q08297 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rad51Q08297 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rad51Q08297 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rad51Q08297 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rad51Q08297 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rad51Q08297 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rad51Q08297 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rad51Q08297 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rad51Q08297 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms