Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tgm3Q08189 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms