Protein–RNA interactions for Protein: Q06666

Srst, Octapeptide-repeat protein T2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrstQ06666 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SrstQ06666 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SrstQ06666 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SrstQ06666 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SrstQ06666 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SrstQ06666 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SrstQ06666 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms