Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrx2Q06348 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms