Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cab39Q06138 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms