Protein–RNA interactions for Protein: Q05AH6

SPINDOC, SPIN1-docking protein, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINDOCQ05AH6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPINDOCQ05AH6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPINDOCQ05AH6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPINDOCQ05AH6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPINDOCQ05AH6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SPINDOCQ05AH6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SPINDOCQ05AH6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPINDOCQ05AH6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPINDOCQ05AH6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SPINDOCQ05AH6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPINDOCQ05AH6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPINDOCQ05AH6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPINDOCQ05AH6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPINDOCQ05AH6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPINDOCQ05AH6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPINDOCQ05AH6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPINDOCQ05AH6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPINDOCQ05AH6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPINDOCQ05AH6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPINDOCQ05AH6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPINDOCQ05AH6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPINDOCQ05AH6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPINDOCQ05AH6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPINDOCQ05AH6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPINDOCQ05AH6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPINDOCQ05AH6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPINDOCQ05AH6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPINDOCQ05AH6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPINDOCQ05AH6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPINDOCQ05AH6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPINDOCQ05AH6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPINDOCQ05AH6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPINDOCQ05AH6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPINDOCQ05AH6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPINDOCQ05AH6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SPINDOCQ05AH6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SPINDOCQ05AH6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPINDOCQ05AH6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPINDOCQ05AH6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPINDOCQ05AH6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPINDOCQ05AH6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SPINDOCQ05AH6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPINDOCQ05AH6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPINDOCQ05AH6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPINDOCQ05AH6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPINDOCQ05AH6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPINDOCQ05AH6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPINDOCQ05AH6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPINDOCQ05AH6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPINDOCQ05AH6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPINDOCQ05AH6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPINDOCQ05AH6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPINDOCQ05AH6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPINDOCQ05AH6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPINDOCQ05AH6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SPINDOCQ05AH6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SPINDOCQ05AH6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SPINDOCQ05AH6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SPINDOCQ05AH6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPINDOCQ05AH6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPINDOCQ05AH6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SPINDOCQ05AH6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPINDOCQ05AH6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPINDOCQ05AH6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPINDOCQ05AH6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPINDOCQ05AH6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPINDOCQ05AH6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPINDOCQ05AH6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPINDOCQ05AH6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPINDOCQ05AH6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SPINDOCQ05AH6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPINDOCQ05AH6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPINDOCQ05AH6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPINDOCQ05AH6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPINDOCQ05AH6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPINDOCQ05AH6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPINDOCQ05AH6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPINDOCQ05AH6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPINDOCQ05AH6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPINDOCQ05AH6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPINDOCQ05AH6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPINDOCQ05AH6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SPINDOCQ05AH6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPINDOCQ05AH6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPINDOCQ05AH6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPINDOCQ05AH6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPINDOCQ05AH6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPINDOCQ05AH6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPINDOCQ05AH6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SPINDOCQ05AH6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPINDOCQ05AH6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPINDOCQ05AH6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPINDOCQ05AH6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPINDOCQ05AH6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPINDOCQ05AH6 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPINDOCQ05AH6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SPINDOCQ05AH6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPINDOCQ05AH6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPINDOCQ05AH6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPINDOCQ05AH6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms