Protein–RNA interactions for Protein: Q05A06

Vmn1r236, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r236Q05A06 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r236Q05A06 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms