Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Thbs3Q05895 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms