Protein–RNA interactions for Protein: Q05722

Col9a1, Collagen alpha-1(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a1Q05722 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Col9a1Q05722 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Col9a1Q05722 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Col9a1Q05722 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col9a1Q05722 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col9a1Q05722 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col9a1Q05722 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col9a1Q05722 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col9a1Q05722 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col9a1Q05722 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col9a1Q05722 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col9a1Q05722 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col9a1Q05722 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col9a1Q05722 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col9a1Q05722 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col9a1Q05722 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col9a1Q05722 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col9a1Q05722 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col9a1Q05722 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col9a1Q05722 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col9a1Q05722 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col9a1Q05722 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col9a1Q05722 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col9a1Q05722 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Col9a1Q05722 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Col9a1Q05722 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Col9a1Q05722 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Col9a1Q05722 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Col9a1Q05722 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Col9a1Q05722 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Col9a1Q05722 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Col9a1Q05722 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Col9a1Q05722 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Col9a1Q05722 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Col9a1Q05722 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Col9a1Q05722 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Col9a1Q05722 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Col9a1Q05722 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Col9a1Q05722 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Col9a1Q05722 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Col9a1Q05722 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col9a1Q05722 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col9a1Q05722 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col9a1Q05722 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col9a1Q05722 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Col9a1Q05722 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col9a1Q05722 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col9a1Q05722 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col9a1Q05722 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col9a1Q05722 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Col9a1Q05722 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Col9a1Q05722 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Col9a1Q05722 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Col9a1Q05722 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Col9a1Q05722 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Col9a1Q05722 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Col9a1Q05722 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Col9a1Q05722 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Col9a1Q05722 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Col9a1Q05722 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Col9a1Q05722 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Col9a1Q05722 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Col9a1Q05722 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Col9a1Q05722 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Col9a1Q05722 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Col9a1Q05722 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Col9a1Q05722 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Col9a1Q05722 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Col9a1Q05722 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Col9a1Q05722 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Col9a1Q05722 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Col9a1Q05722 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Col9a1Q05722 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Col9a1Q05722 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Col9a1Q05722 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Col9a1Q05722 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Col9a1Q05722 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Col9a1Q05722 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Col9a1Q05722 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Col9a1Q05722 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Col9a1Q05722 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Col9a1Q05722 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Col9a1Q05722 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Col9a1Q05722 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Col9a1Q05722 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Col9a1Q05722 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Col9a1Q05722 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Col9a1Q05722 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Col9a1Q05722 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Col9a1Q05722 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Col9a1Q05722 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Col9a1Q05722 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Col9a1Q05722 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Col9a1Q05722 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Col9a1Q05722 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Col9a1Q05722 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Col9a1Q05722 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Col9a1Q05722 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Col9a1Q05722 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Col9a1Q05722 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms