Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Sox12Q04890 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Sox12Q04890 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sox12Q04890 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sox12Q04890 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sox12Q04890 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sox12Q04890 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sox12Q04890 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sox12Q04890 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sox12Q04890 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sox12Q04890 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sox12Q04890 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sox12Q04890 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sox12Q04890 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sox12Q04890 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sox12Q04890 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sox12Q04890 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sox12Q04890 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Sox12Q04890 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sox12Q04890 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sox12Q04890 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sox12Q04890 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sox12Q04890 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sox12Q04890 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sox12Q04890 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sox12Q04890 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sox12Q04890 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sox12Q04890 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sox12Q04890 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sox12Q04890 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sox12Q04890 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sox12Q04890 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sox12Q04890 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sox12Q04890 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sox12Q04890 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sox12Q04890 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sox12Q04890 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sox12Q04890 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sox12Q04890 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Sox12Q04890 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Sox12Q04890 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sox12Q04890 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sox12Q04890 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sox12Q04890 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Sox12Q04890 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sox12Q04890 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Sox12Q04890 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sox12Q04890 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sox12Q04890 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sox12Q04890 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sox12Q04890 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sox12Q04890 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sox12Q04890 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sox12Q04890 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sox12Q04890 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sox12Q04890 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sox12Q04890 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sox12Q04890 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sox12Q04890 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sox12Q04890 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sox12Q04890 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sox12Q04890 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sox12Q04890 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sox12Q04890 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sox12Q04890 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sox12Q04890 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sox12Q04890 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sox12Q04890 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sox12Q04890 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sox12Q04890 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sox12Q04890 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sox12Q04890 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sox12Q04890 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sox12Q04890 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sox12Q04890 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sox12Q04890 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Sox12Q04890 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sox12Q04890 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Sox12Q04890 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sox12Q04890 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sox12Q04890 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sox12Q04890 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sox12Q04890 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sox12Q04890 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sox12Q04890 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Sox12Q04890 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sox12Q04890 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Sox12Q04890 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sox12Q04890 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sox12Q04890 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Sox12Q04890 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sox12Q04890 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sox12Q04890 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sox12Q04890 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sox12Q04890 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sox12Q04890 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sox12Q04890 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sox12Q04890 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sox12Q04890 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sox12Q04890 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms