Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Ccl7Q03366 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl7Q03366 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms