Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Thbs2Q03350 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms