Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NfiaQ02780 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NfiaQ02780 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NfiaQ02780 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NfiaQ02780 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NfiaQ02780 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NfiaQ02780 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NfiaQ02780 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NfiaQ02780 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NfiaQ02780 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NfiaQ02780 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NfiaQ02780 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NfiaQ02780 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NfiaQ02780 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NfiaQ02780 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NfiaQ02780 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NfiaQ02780 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NfiaQ02780 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NfiaQ02780 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NfiaQ02780 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NfiaQ02780 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NfiaQ02780 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NfiaQ02780 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NfiaQ02780 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NfiaQ02780 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NfiaQ02780 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NfiaQ02780 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NfiaQ02780 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NfiaQ02780 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NfiaQ02780 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NfiaQ02780 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NfiaQ02780 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NfiaQ02780 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NfiaQ02780 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NfiaQ02780 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NfiaQ02780 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NfiaQ02780 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NfiaQ02780 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NfiaQ02780 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NfiaQ02780 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NfiaQ02780 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NfiaQ02780 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NfiaQ02780 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NfiaQ02780 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NfiaQ02780 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NfiaQ02780 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NfiaQ02780 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NfiaQ02780 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NfiaQ02780 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NfiaQ02780 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NfiaQ02780 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
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NfiaQ02780 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NfiaQ02780 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NfiaQ02780 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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NfiaQ02780 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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NfiaQ02780 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NfiaQ02780 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NfiaQ02780 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NfiaQ02780 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NfiaQ02780 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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NfiaQ02780 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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NfiaQ02780 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NfiaQ02780 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
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NfiaQ02780 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NfiaQ02780 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NfiaQ02780 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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NfiaQ02780 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NfiaQ02780 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NfiaQ02780 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NfiaQ02780 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
NfiaQ02780 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NfiaQ02780 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NfiaQ02780 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NfiaQ02780 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
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NfiaQ02780 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NfiaQ02780 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NfiaQ02780 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NfiaQ02780 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NfiaQ02780 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NfiaQ02780 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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