Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gjb5Q02739 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms