Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gjb4Q02738 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gjb4Q02738 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gjb4Q02738 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gjb4Q02738 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gjb4Q02738 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gjb4Q02738 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gjb4Q02738 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gjb4Q02738 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gjb4Q02738 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gjb4Q02738 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gjb4Q02738 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gjb4Q02738 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gjb4Q02738 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gjb4Q02738 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gjb4Q02738 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gjb4Q02738 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gjb4Q02738 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gjb4Q02738 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gjb4Q02738 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gjb4Q02738 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gjb4Q02738 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gjb4Q02738 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gjb4Q02738 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gjb4Q02738 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjb4Q02738 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjb4Q02738 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjb4Q02738 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjb4Q02738 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjb4Q02738 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjb4Q02738 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjb4Q02738 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjb4Q02738 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjb4Q02738 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjb4Q02738 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjb4Q02738 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjb4Q02738 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjb4Q02738 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gjb4Q02738 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gjb4Q02738 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gjb4Q02738 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gjb4Q02738 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gjb4Q02738 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gjb4Q02738 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Gjb4Q02738 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gjb4Q02738 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gjb4Q02738 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gjb4Q02738 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gjb4Q02738 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gjb4Q02738 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gjb4Q02738 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gjb4Q02738 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gjb4Q02738 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gjb4Q02738 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gjb4Q02738 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gjb4Q02738 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gjb4Q02738 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gjb4Q02738 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gjb4Q02738 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gjb4Q02738 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gjb4Q02738 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Gjb4Q02738 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gjb4Q02738 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gjb4Q02738 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gjb4Q02738 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gjb4Q02738 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gjb4Q02738 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Gjb4Q02738 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Gjb4Q02738 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gjb4Q02738 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gjb4Q02738 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gjb4Q02738 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjb4Q02738 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjb4Q02738 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjb4Q02738 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjb4Q02738 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjb4Q02738 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjb4Q02738 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjb4Q02738 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjb4Q02738 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjb4Q02738 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjb4Q02738 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjb4Q02738 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjb4Q02738 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjb4Q02738 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjb4Q02738 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjb4Q02738 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjb4Q02738 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjb4Q02738 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjb4Q02738 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjb4Q02738 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjb4Q02738 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjb4Q02738 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjb4Q02738 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjb4Q02738 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjb4Q02738 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjb4Q02738 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjb4Q02738 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gjb4Q02738 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Gjb4Q02738 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms