Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GscQ02591 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GscQ02591 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GscQ02591 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GscQ02591 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GscQ02591 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GscQ02591 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GscQ02591 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GscQ02591 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GscQ02591 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GscQ02591 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GscQ02591 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GscQ02591 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GscQ02591 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GscQ02591 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GscQ02591 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GscQ02591 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GscQ02591 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GscQ02591 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GscQ02591 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GscQ02591 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GscQ02591 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GscQ02591 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GscQ02591 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GscQ02591 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GscQ02591 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GscQ02591 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GscQ02591 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GscQ02591 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GscQ02591 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GscQ02591 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GscQ02591 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GscQ02591 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GscQ02591 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GscQ02591 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GscQ02591 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GscQ02591 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GscQ02591 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GscQ02591 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GscQ02591 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GscQ02591 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GscQ02591 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GscQ02591 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GscQ02591 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GscQ02591 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GscQ02591 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GscQ02591 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GscQ02591 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GscQ02591 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GscQ02591 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GscQ02591 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GscQ02591 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GscQ02591 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GscQ02591 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GscQ02591 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GscQ02591 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GscQ02591 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GscQ02591 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GscQ02591 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GscQ02591 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GscQ02591 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GscQ02591 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GscQ02591 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GscQ02591 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GscQ02591 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GscQ02591 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GscQ02591 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GscQ02591 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GscQ02591 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GscQ02591 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GscQ02591 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GscQ02591 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GscQ02591 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GscQ02591 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GscQ02591 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GscQ02591 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GscQ02591 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GscQ02591 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GscQ02591 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GscQ02591 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GscQ02591 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GscQ02591 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GscQ02591 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GscQ02591 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GscQ02591 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GscQ02591 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GscQ02591 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GscQ02591 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GscQ02591 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GscQ02591 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GscQ02591 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GscQ02591 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GscQ02591 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GscQ02591 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GscQ02591 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GscQ02591 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GscQ02591 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GscQ02591 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GscQ02591 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GscQ02591 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms