Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nhlh1Q02576 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nhlh1Q02576 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nhlh1Q02576 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Nhlh1Q02576 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nhlh1Q02576 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Nhlh1Q02576 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nhlh1Q02576 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nhlh1Q02576 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nhlh1Q02576 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nhlh1Q02576 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nhlh1Q02576 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nhlh1Q02576 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nhlh1Q02576 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nhlh1Q02576 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nhlh1Q02576 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms