Protein–RNA interactions for Protein: Q02496

Muc1, Mucin-1, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Muc1Q02496 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Muc1Q02496 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Muc1Q02496 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Muc1Q02496 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Muc1Q02496 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Muc1Q02496 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Muc1Q02496 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Muc1Q02496 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Muc1Q02496 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Muc1Q02496 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Muc1Q02496 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Muc1Q02496 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Muc1Q02496 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Muc1Q02496 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Muc1Q02496 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Muc1Q02496 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Muc1Q02496 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Muc1Q02496 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Muc1Q02496 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Muc1Q02496 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Muc1Q02496 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Muc1Q02496 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Muc1Q02496 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Muc1Q02496 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Muc1Q02496 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Muc1Q02496 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Muc1Q02496 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Muc1Q02496 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Muc1Q02496 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Muc1Q02496 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Muc1Q02496 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Muc1Q02496 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Muc1Q02496 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Muc1Q02496 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Muc1Q02496 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Muc1Q02496 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Muc1Q02496 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Muc1Q02496 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Muc1Q02496 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Muc1Q02496 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Muc1Q02496 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Muc1Q02496 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Muc1Q02496 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Muc1Q02496 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Muc1Q02496 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Muc1Q02496 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Muc1Q02496 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Muc1Q02496 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Muc1Q02496 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Muc1Q02496 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Muc1Q02496 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Muc1Q02496 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Muc1Q02496 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Muc1Q02496 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Muc1Q02496 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Muc1Q02496 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Muc1Q02496 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Muc1Q02496 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Muc1Q02496 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Muc1Q02496 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Muc1Q02496 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Muc1Q02496 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Muc1Q02496 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Muc1Q02496 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Muc1Q02496 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Muc1Q02496 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Muc1Q02496 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Muc1Q02496 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Muc1Q02496 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Muc1Q02496 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Muc1Q02496 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Muc1Q02496 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Muc1Q02496 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Muc1Q02496 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Muc1Q02496 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Muc1Q02496 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Muc1Q02496 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Muc1Q02496 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Muc1Q02496 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Muc1Q02496 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Muc1Q02496 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Muc1Q02496 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Muc1Q02496 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Muc1Q02496 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Muc1Q02496 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Muc1Q02496 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Muc1Q02496 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Muc1Q02496 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Muc1Q02496 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Muc1Q02496 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Muc1Q02496 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Muc1Q02496 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Muc1Q02496 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Muc1Q02496 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Muc1Q02496 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Muc1Q02496 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Muc1Q02496 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Muc1Q02496 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Muc1Q02496 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Muc1Q02496 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms