Protein–RNA interactions for Protein: Q02284

Htr1f, 5-hydroxytryptamine receptor 1F, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr1fQ02284 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Htr1fQ02284 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Htr1fQ02284 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms