Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VcpQ01853 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VcpQ01853 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VcpQ01853 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
VcpQ01853 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VcpQ01853 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VcpQ01853 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VcpQ01853 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VcpQ01853 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms