Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd1Q01822 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd1Q01822 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd1Q01822 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd1Q01822 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd1Q01822 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd1Q01822 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd1Q01822 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd1Q01822 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd1Q01822 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd1Q01822 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd1Q01822 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd1Q01822 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd1Q01822 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd1Q01822 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd1Q01822 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd1Q01822 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd1Q01822 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd1Q01822 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd1Q01822 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd1Q01822 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd1Q01822 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd1Q01822 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd1Q01822 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd1Q01822 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd1Q01822 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd1Q01822 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd1Q01822 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd1Q01822 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd1Q01822 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd1Q01822 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd1Q01822 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd1Q01822 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd1Q01822 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd1Q01822 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd1Q01822 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd1Q01822 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd1Q01822 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd1Q01822 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd1Q01822 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd1Q01822 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd1Q01822 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxd1Q01822 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxd1Q01822 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxd1Q01822 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd1Q01822 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms