Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Top2aQ01320 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Top2aQ01320 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Top2aQ01320 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Top2aQ01320 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Top2aQ01320 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Top2aQ01320 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Top2aQ01320 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Top2aQ01320 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Top2aQ01320 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Top2aQ01320 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Top2aQ01320 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Top2aQ01320 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Top2aQ01320 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Top2aQ01320 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Top2aQ01320 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Top2aQ01320 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Top2aQ01320 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Top2aQ01320 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Top2aQ01320 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Top2aQ01320 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Top2aQ01320 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Top2aQ01320 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Top2aQ01320 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Top2aQ01320 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Top2aQ01320 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Top2aQ01320 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Top2aQ01320 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Top2aQ01320 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Top2aQ01320 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Top2aQ01320 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Top2aQ01320 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Top2aQ01320 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Top2aQ01320 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Top2aQ01320 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Top2aQ01320 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Top2aQ01320 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Top2aQ01320 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Top2aQ01320 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Top2aQ01320 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Top2aQ01320 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Top2aQ01320 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Top2aQ01320 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Top2aQ01320 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Top2aQ01320 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Top2aQ01320 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Top2aQ01320 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Top2aQ01320 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Top2aQ01320 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Top2aQ01320 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Top2aQ01320 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Top2aQ01320 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Top2aQ01320 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Top2aQ01320 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Top2aQ01320 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Top2aQ01320 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Top2aQ01320 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Top2aQ01320 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Top2aQ01320 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Top2aQ01320 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Top2aQ01320 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Top2aQ01320 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Top2aQ01320 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Top2aQ01320 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Top2aQ01320 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Top2aQ01320 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Top2aQ01320 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Top2aQ01320 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Top2aQ01320 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Top2aQ01320 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Top2aQ01320 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Top2aQ01320 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Top2aQ01320 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Top2aQ01320 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Top2aQ01320 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Top2aQ01320 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Top2aQ01320 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Top2aQ01320 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Top2aQ01320 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Top2aQ01320 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Top2aQ01320 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Top2aQ01320 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Top2aQ01320 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Top2aQ01320 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Top2aQ01320 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Top2aQ01320 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Top2aQ01320 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Top2aQ01320 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Top2aQ01320 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Top2aQ01320 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Top2aQ01320 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Top2aQ01320 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Top2aQ01320 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Top2aQ01320 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Top2aQ01320 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Top2aQ01320 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Top2aQ01320 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Top2aQ01320 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Top2aQ01320 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Top2aQ01320 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms