Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EgfrQ01279 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EgfrQ01279 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
EgfrQ01279 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EgfrQ01279 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EgfrQ01279 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EgfrQ01279 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EgfrQ01279 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EgfrQ01279 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EgfrQ01279 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EgfrQ01279 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EgfrQ01279 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EgfrQ01279 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EgfrQ01279 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EgfrQ01279 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EgfrQ01279 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EgfrQ01279 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EgfrQ01279 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EgfrQ01279 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EgfrQ01279 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EgfrQ01279 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EgfrQ01279 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EgfrQ01279 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EgfrQ01279 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EgfrQ01279 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EgfrQ01279 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EgfrQ01279 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
EgfrQ01279 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EgfrQ01279 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EgfrQ01279 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EgfrQ01279 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
EgfrQ01279 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EgfrQ01279 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EgfrQ01279 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EgfrQ01279 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EgfrQ01279 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EgfrQ01279 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EgfrQ01279 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EgfrQ01279 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EgfrQ01279 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EgfrQ01279 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EgfrQ01279 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EgfrQ01279 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EgfrQ01279 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EgfrQ01279 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EgfrQ01279 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
EgfrQ01279 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EgfrQ01279 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EgfrQ01279 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EgfrQ01279 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EgfrQ01279 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EgfrQ01279 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EgfrQ01279 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
EgfrQ01279 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.07
EgfrQ01279 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EgfrQ01279 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EgfrQ01279 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EgfrQ01279 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EgfrQ01279 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EgfrQ01279 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EgfrQ01279 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EgfrQ01279 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EgfrQ01279 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EgfrQ01279 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EgfrQ01279 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EgfrQ01279 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EgfrQ01279 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EgfrQ01279 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EgfrQ01279 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EgfrQ01279 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EgfrQ01279 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EgfrQ01279 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EgfrQ01279 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EgfrQ01279 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EgfrQ01279 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EgfrQ01279 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EgfrQ01279 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EgfrQ01279 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EgfrQ01279 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EgfrQ01279 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EgfrQ01279 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EgfrQ01279 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EgfrQ01279 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EgfrQ01279 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
EgfrQ01279 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EgfrQ01279 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EgfrQ01279 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EgfrQ01279 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
EgfrQ01279 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EgfrQ01279 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EgfrQ01279 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EgfrQ01279 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EgfrQ01279 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EgfrQ01279 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EgfrQ01279 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EgfrQ01279 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EgfrQ01279 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
EgfrQ01279 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EgfrQ01279 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EgfrQ01279 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms