Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pde1bQ01065 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pde1bQ01065 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pde1bQ01065 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pde1bQ01065 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pde1bQ01065 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pde1bQ01065 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pde1bQ01065 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pde1bQ01065 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pde1bQ01065 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pde1bQ01065 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pde1bQ01065 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pde1bQ01065 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pde1bQ01065 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pde1bQ01065 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pde1bQ01065 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pde1bQ01065 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pde1bQ01065 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pde1bQ01065 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pde1bQ01065 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Pde1bQ01065 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pde1bQ01065 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pde1bQ01065 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pde1bQ01065 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pde1bQ01065 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pde1bQ01065 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pde1bQ01065 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pde1bQ01065 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pde1bQ01065 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pde1bQ01065 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pde1bQ01065 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pde1bQ01065 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pde1bQ01065 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pde1bQ01065 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pde1bQ01065 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pde1bQ01065 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pde1bQ01065 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pde1bQ01065 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pde1bQ01065 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pde1bQ01065 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pde1bQ01065 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pde1bQ01065 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Pde1bQ01065 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pde1bQ01065 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Pde1bQ01065 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pde1bQ01065 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pde1bQ01065 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pde1bQ01065 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pde1bQ01065 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pde1bQ01065 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pde1bQ01065 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pde1bQ01065 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pde1bQ01065 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pde1bQ01065 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pde1bQ01065 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pde1bQ01065 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pde1bQ01065 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pde1bQ01065 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pde1bQ01065 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pde1bQ01065 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pde1bQ01065 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pde1bQ01065 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pde1bQ01065 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pde1bQ01065 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pde1bQ01065 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pde1bQ01065 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pde1bQ01065 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pde1bQ01065 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pde1bQ01065 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pde1bQ01065 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pde1bQ01065 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pde1bQ01065 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pde1bQ01065 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pde1bQ01065 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pde1bQ01065 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pde1bQ01065 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms