Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gjb2Q00977 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gjb2Q00977 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gjb2Q00977 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gjb2Q00977 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gjb2Q00977 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gjb2Q00977 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gjb2Q00977 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gjb2Q00977 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gjb2Q00977 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gjb2Q00977 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gjb2Q00977 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gjb2Q00977 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gjb2Q00977 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gjb2Q00977 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gjb2Q00977 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gjb2Q00977 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gjb2Q00977 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gjb2Q00977 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gjb2Q00977 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gjb2Q00977 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gjb2Q00977 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gjb2Q00977 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gjb2Q00977 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gjb2Q00977 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gjb2Q00977 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gjb2Q00977 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gjb2Q00977 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gjb2Q00977 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gjb2Q00977 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gjb2Q00977 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gjb2Q00977 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gjb2Q00977 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gjb2Q00977 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gjb2Q00977 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gjb2Q00977 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gjb2Q00977 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gjb2Q00977 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gjb2Q00977 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gjb2Q00977 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gjb2Q00977 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gjb2Q00977 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gjb2Q00977 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gjb2Q00977 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gjb2Q00977 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gjb2Q00977 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gjb2Q00977 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gjb2Q00977 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gjb2Q00977 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gjb2Q00977 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gjb2Q00977 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gjb2Q00977 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gjb2Q00977 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gjb2Q00977 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gjb2Q00977 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gjb2Q00977 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Gjb2Q00977 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gjb2Q00977 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gjb2Q00977 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gjb2Q00977 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjb2Q00977 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjb2Q00977 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjb2Q00977 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjb2Q00977 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjb2Q00977 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjb2Q00977 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjb2Q00977 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjb2Q00977 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjb2Q00977 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjb2Q00977 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjb2Q00977 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjb2Q00977 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjb2Q00977 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjb2Q00977 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjb2Q00977 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjb2Q00977 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjb2Q00977 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjb2Q00977 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjb2Q00977 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjb2Q00977 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjb2Q00977 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjb2Q00977 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjb2Q00977 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gjb2Q00977 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gjb2Q00977 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gjb2Q00977 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gjb2Q00977 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gjb2Q00977 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gjb2Q00977 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gjb2Q00977 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gjb2Q00977 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gjb2Q00977 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gjb2Q00977 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Gjb2Q00977 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gjb2Q00977 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gjb2Q00977 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Gjb2Q00977 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gjb2Q00977 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gjb2Q00977 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gjb2Q00977 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms